En su interior se produce, además, un fenómeno bastante atípico. Se dice que en una de sus hectáreas hay 220 especies de árboles mientras que en los bosques europeos tan sólo habría 20 especies. Hay árboles como el cedro, el tornillo, la castaña o la lupuna, entre otros muchos. 

 

El parque es un lugar reservado y tan sólo hay unas pocas zonas a las que se pueda acceder. Para ir hasta él, hay dos vías. Una es terrestre desde la ciudad de Cuzco. El viaje dura unas 12 horas, hasta Atalaya o Shintuya, luego por vía fluvial (6 horas) a través de los ríos Alto Madre de Dios y Manú. Y la segunda: por vía aérea, nada más que 30 minutos. Esto no quiere decir que no haya vida en su interior. En el Parque Nacional de Manú se sabe que viven más de treinta comunidades campesinas donde el quechua sigue siendo la lengua base así como distintos grupos indígenas. Además hay restos arqueológicos aún no estudiados o los famosos Petroglificos de Pusharo, en la región del río Palatoa y las Ruinas de Mameria.